W muzealnym sklepie można znaleźć wydawnictwa MMK, między innymi katalogi wystaw. Dostępne są również liczne książki, komiksy dla dzieci i młodzieży oraz publikacje związane z Mikołajem Kopernikiem i jego epoką oraz naszym regionem. Dla naszych młodszych oraz starszych miłośników astronoma przygotowaliśmy różnorodne gadżety. Oferujemy kolorowe magnesy, kubki, puzzle, kolorowanki oraz gry.

Posiadamy również w sprzedaży notesy, zakładki magnetyczne, torby bawełniane oraz inne drobiazgi z reprodukcjami grafik, obrazów i map z naszych zbiorów.